MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 53673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	CTT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
2	NC_008508	ACA	2	6	45	50	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326853
3	NC_008508	TTC	2	6	206	211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
4	NC_008508	TCCGAC	2	12	281	292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116326853
5	NC_008508	CGA	2	6	516	521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326853
6	NC_008508	TCA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
7	NC_008508	TTGTC	2	10	563	572	0 %	60 %	20 %	20 %	116326853
8	NC_008508	GAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326853
9	NC_008508	TCG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326853
10	NC_008508	ACA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326853
11	NC_008508	TTC	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
12	NC_008508	GAA	2	6	714	719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326853
13	NC_008508	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
14	NC_008508	TCT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
15	NC_008508	GA	3	6	907	912	50 %	0 %	50 %	0 %	116326853
16	NC_008508	CTT	2	6	933	938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
17	NC_008508	ACC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326853
18	NC_008508	TCGA	2	8	1049	1056	25 %	25 %	25 %	25 %	116326853
19	NC_008508	TCT	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
20	NC_008508	TTC	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326853
21	NC_008508	GA	3	6	1402	1407	50 %	0 %	50 %	0 %	116326853
22	NC_008508	T	8	8	1582	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	116326853
23	NC_008508	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326853
24	NC_008508	CCG	2	6	1685	1690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326853
25	NC_008508	CCTC	2	8	1701	1708	0 %	25 %	0 %	75 %	116326853
26	NC_008508	GCC	2	6	1729	1734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326853
27	NC_008508	CTC	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326853
28	NC_008508	CTA	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
29	NC_008508	A	7	7	1879	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	116326853
30	NC_008508	ATC	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326853
31	NC_008508	ACC	2	6	2148	2153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326854
32	NC_008508	GGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326854
33	NC_008508	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326854
34	NC_008508	ATA	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326854
35	NC_008508	ACTCG	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	116326854
36	NC_008508	ACAAA	2	10	2272	2281	80 %	0 %	0 %	20 %	116326854
37	NC_008508	AGA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
38	NC_008508	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	116326854
39	NC_008508	TTGAT	2	10	2305	2314	20 %	60 %	20 %	0 %	116326854
40	NC_008508	ACG	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326854
41	NC_008508	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
42	NC_008508	GAT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326854
43	NC_008508	CGG	2	6	2531	2536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326854
44	NC_008508	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326854
45	NC_008508	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
46	NC_008508	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
47	NC_008508	TTTTC	2	10	2803	2812	0 %	80 %	0 %	20 %	116326854
48	NC_008508	A	6	6	2891	2896	100 %	0 %	0 %	0 %	116326854
49	NC_008508	TTC	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326854
50	NC_008508	AGA	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326854
51	NC_008508	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326855
52	NC_008508	T	6	6	3035	3040	0 %	100 %	0 %	0 %	116326855
53	NC_008508	TCC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326855
54	NC_008508	TCT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
55	NC_008508	CGGA	2	8	3097	3104	25 %	0 %	50 %	25 %	116326855
56	NC_008508	TTA	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
57	NC_008508	TAT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
58	NC_008508	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
59	NC_008508	GTTG	2	8	3295	3302	0 %	50 %	50 %	0 %	116326855
60	NC_008508	TTCG	2	8	3304	3311	0 %	50 %	25 %	25 %	116326855
61	NC_008508	TTA	2	6	3399	3404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326855
62	NC_008508	GAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
63	NC_008508	CAT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326855
64	NC_008508	AC	3	6	3463	3468	50 %	0 %	0 %	50 %	116326855
65	NC_008508	TTCCA	2	10	3502	3511	20 %	40 %	0 %	40 %	116326855
66	NC_008508	A	7	7	3534	3540	100 %	0 %	0 %	0 %	116326855
67	NC_008508	AGG	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326855
68	NC_008508	AAG	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326855
69	NC_008508	A	6	6	3634	3639	100 %	0 %	0 %	0 %	116326855
70	NC_008508	AAACT	2	10	3655	3664	60 %	20 %	0 %	20 %	116326855
71	NC_008508	TCT	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
72	NC_008508	TCT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326855
73	NC_008508	GAAA	2	8	3722	3729	75 %	0 %	25 %	0 %	116326855
74	NC_008508	TC	3	6	3809	3814	0 %	50 %	0 %	50 %	116326855
75	NC_008508	GGA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326856
76	NC_008508	A	7	7	4293	4299	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
77	NC_008508	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
78	NC_008508	GAAA	2	8	4407	4414	75 %	0 %	25 %	0 %	116326856
79	NC_008508	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326856
80	NC_008508	AAAT	2	8	4645	4652	75 %	25 %	0 %	0 %	116326856
81	NC_008508	AC	3	6	4689	4694	50 %	0 %	0 %	50 %	116326856
82	NC_008508	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
83	NC_008508	A	6	6	4725	4730	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
84	NC_008508	TCT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
85	NC_008508	ATGA	2	8	4773	4780	50 %	25 %	25 %	0 %	116326856
86	NC_008508	TCT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
87	NC_008508	GAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326856
88	NC_008508	CTT	2	6	4872	4877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
89	NC_008508	A	6	6	4891	4896	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
90	NC_008508	T	6	6	4908	4913	0 %	100 %	0 %	0 %	116326856
91	NC_008508	TTTTC	2	10	4925	4934	0 %	80 %	0 %	20 %	116326856
92	NC_008508	GAAA	2	8	4935	4942	75 %	0 %	25 %	0 %	116326856
93	NC_008508	CAA	2	6	5048	5053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326856
94	NC_008508	GAA	2	6	5145	5150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326856
95	NC_008508	ATTT	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	116326856
96	NC_008508	A	6	6	5196	5201	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
97	NC_008508	CTT	2	6	5211	5216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
98	NC_008508	T	7	7	5215	5221	0 %	100 %	0 %	0 %	116326856
99	NC_008508	A	6	6	5249	5254	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
100	NC_008508	A	8	8	5268	5275	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
101	NC_008508	ATT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326856
102	NC_008508	A	7	7	5360	5366	100 %	0 %	0 %	0 %	116326856
103	NC_008508	ACA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326856
104	NC_008508	GAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326856
105	NC_008508	CTT	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326856
106	NC_008508	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	116326857
107	NC_008508	TAT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326857
108	NC_008508	GAA	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
109	NC_008508	TTTC	2	8	6805	6812	0 %	75 %	0 %	25 %	116326857
110	NC_008508	AAC	2	6	6893	6898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326857
111	NC_008508	T	7	7	6906	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	116326857
112	NC_008508	AGA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
113	NC_008508	GAA	2	6	7039	7044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
114	NC_008508	ACGG	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	116326857
115	NC_008508	CTTC	2	8	7249	7256	0 %	50 %	0 %	50 %	116326857
116	NC_008508	GAT	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326857
117	NC_008508	GAA	2	6	7480	7485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
118	NC_008508	GCG	2	6	7516	7521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326857
119	NC_008508	GAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326857
120	NC_008508	GAAAT	2	10	7634	7643	60 %	20 %	20 %	0 %	116326857
121	NC_008508	CGA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326857
122	NC_008508	TCCG	2	8	7752	7759	0 %	25 %	25 %	50 %	116326857
123	NC_008508	GAA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326858
124	NC_008508	T	8	8	7876	7883	0 %	100 %	0 %	0 %	116326858
125	NC_008508	GGAA	2	8	7898	7905	50 %	0 %	50 %	0 %	116326858
126	NC_008508	TCT	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326858
127	NC_008508	ATT	2	6	7999	8004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326858
128	NC_008508	TCAA	2	8	8095	8102	50 %	25 %	0 %	25 %	116326858
129	NC_008508	A	8	8	8111	8118	100 %	0 %	0 %	0 %	116326858
130	NC_008508	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326858
131	NC_008508	TTA	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326858
132	NC_008508	GGC	2	6	8184	8189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
133	NC_008508	CGG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
134	NC_008508	ATA	2	6	8266	8271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326858
135	NC_008508	TAA	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326858
136	NC_008508	AAGAA	2	10	8381	8390	80 %	0 %	20 %	0 %	116326858
137	NC_008508	GCG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326858
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